步骤如下：
前提步骤，如果你之前没用过百度站长平台。
一：注册百度账号并登陆 http://zhanzhang.baidu.com/
二：进入添加域名，验证域名，有别名验证，TXT验证和HTML代码验证三种。
已有账号且已验证请看这里：
一：访问 http://zn.baidu.com/cse/home/index
二：点击右边的 进入管理后台 【注意，不是API引擎这里。】
三：搜索引擎管理-新建搜索引擎
四：选择域名，填写名称，记录地址栏最后一串数字即可。
五：下一步，随便选一个，然后提交，这里不影响，ID我们已经获取。
六：来到自己网站-后台-页面-新增页面-页面模板选择百度搜索-填写页面名称和设置URL后发布。
七：进入外观-主题设置-基本设置-百度站内搜索-启用-填写ID-选择刚才添加的页面-保存即可。
OK，感谢鸟哥指点，其实我一开始申请错了地方，就是API那里，然后一直发现怪怪的。
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2018年03月07日 10:28 -9楼
我的 Begin 主题下添加百度站内搜索后，搜索竟然是空白，啥都不显示，无语了！
2018年11月23日 13:12 地下1层
@明月登楼 和你的一样，搜索结果是空白
2018年12月29日 16:01 地下2层
@中意眼镜工作室 你们估计弄到API那边了。自己看清楚步骤。